一、露脊鲸科
露脊鲸科是须鲸小目下属的一个科，因没有背鳍而得名，特征是体型大、身体肥胖、行动迟缓、口裂弯曲、须板长，共有2属4种，分别是真露脊鲸属的北大西洋露脊鲸、北太平洋露脊鲸(黑露脊鲸)和露脊鲸属的南露脊鲸、弓头鲸(北极露脊鲸)。
二、新须鲸科
新须鲸科(小露脊鲸科)是须鲸小目下属的一个科，本科只有小露脊鲸一个物种，小露脊鲸别称侏真鲸、倭露脊鲸、新露脊鲸等，雌性最大体长6.45米，雄性最大体长6.09米，仅分布于南半球南纬31～53°，多见于澳洲东南和西南、非洲南部、南美洲南部等地。
三、须鲸科
须鲸科是须鲸小目下属的一个科，事实上须鲸科也是须鲸小目最大的一个科，共有2属9种，分别是须鲸属的长须鲸、塞鲸、布氏鲸、小布氏鲸、蓝鲸、小须鲸、南极小须鲸、角岛鲸和大翅鲸属的大翅鲸(座头鲸)。
四、灰鲸科
灰鲸科是须鲸小目下属的一个科，本科只有灰鲸一个物种，灰鲸别称克鲸、掘贝者、弱鲸等，体长在10～15米之间，最大体重可超过35吨，主要分布在北太平洋、北大西洋等温带海域，我国黄海、东海、南海均有分布。
五、抹香鲸科
抹香鲸科是齿鲸小目下属的一个科，本科只有抹香鲸一个物种，抹香鲸别称巨抹香鲸、卡切拉特鲸等，雄性体长11～20米，雌性体长8.2～18米，成年体重25～45吨，广泛分布于全世界不结冰的海域，从赤道到两极都有分布。
六、小抹香鲸科
小抹香鲸科是齿鲸小目下属的一个科，本科只有1属2种，分别是小抹香鲸属的小抹香鲸、拟小抹香鲸，其中小抹香鲸主要栖息在热带和温带海洋大陆架边缘外的深水区，拟小抹香鲸主要分布在太平洋，我国仅见于台湾沿海。
七、河豚科
河豚科是齿鲸小目下属的一个科，别称淡水豚科、喙豚科、恒河豚科等，共有4属4种，分别是亚马逊河豚属的亚马逊河豚、白鳍豚属的白鳍豚、南亚河豚属的南亚河豚、拉普拉塔河河豚属的拉普拉塔河河豚。
八、喙鲸科
喙鲸科是齿鲸小目下属的一个科，本科共有6属22种，代表物种有贝喙鲸属的贝氏喙鲸，瓶鼻鲸属的北瓶鼻鲸、中喙鲸属的索氏中喙鲸、太喙鲸属的朗氏中喙鲸、塔喙鲸属的谢氏塔喙鲸、柯喙鲸属的柯氏喙鲸等。
九、亚河豚科
亚河豚科是齿鲸小目下属的一个科，本科只有亚河豚一个物种，亚河豚别称亚马逊江豚，事实上亚河豚也是体型最大的淡水豚类，最主要栖息在南美洲的奥里诺科盆地、亚马逊盆地以及马德拉河上游三地。
十、拉河豚科
拉河豚科是齿鲸小目下属的一个科，本科只有拉河豚一个物种，拉河豚别称拉普拉塔河豚，事实上拉河豚也是唯一栖居在海中的淡水豚类，但还是喜生活在沿岸的浅水海域，分布范围从巴西雷任西亚附近的多石河向南穿越乌拉圭至阿根廷的布兰卡湾。
十一、海豚科
海豚科是齿鲸小目下属的一个科，本科共有5亚科17属40多种，代表物种有糙齿海豚亚科的糙齿海豚、海豚亚科的中华白海豚和瓶鼻海豚、露脊海豚亚科的北露脊海豚和南露脊海豚、领航鲸亚科的领航鲸和瓜头鲸、虎鲸亚科的虎鲸等。
十二、鼠海豚科
鼠海豚科是齿鲸小目下属的一个科，本科种类较少，分布于不及海豚科广泛，共3属6种，分别是鼠海豚属的大西洋鼠海豚、海湾鼠海豚、阿根廷鼠海豚和江豚属的长江江豚、印太江豚及眼斑海豚属的眼斑海豚。
十三、一角鲸科
一角鲸科是齿鲸小目下属的一个科，本科只有一角鲸一个物种，一角鲸别称独角鲸、长枪鲸等，分布范围是所有鲸豚类中分布最北者，不连续地分布于北极附近，大多在北极圈以北及冰帽边缘，很少越过北纬70度以南。
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